这座大型的古墓群约有300余座墓葬，是东汉初年拓跋鲜卑部落从大兴安岭东南麓的原始森林中来到水草丰美的扎赉诺尔地区，在这里生活了一百多年后留下的。拓跋鲜卑部落在这里发展壮大，后入主中原建立了北魏王朝。

1960年夏，考古部门清理了31座古墓，其中单人墓葬26座，双人墓葬2座，小孩墓葬2座，母子合葬墓1座，出土遗物300余件。这些古墓均为土坑竖穴墓，葬具为木棺，大多有盖无底。墓中的尸骨几乎都是仰身直肢，头向北安放在棺木中。墓葬中还有大量的牛、马、羊殉葬和陶器、铜器、骨器、木器、贝壳等随葬品。

2006年5月，扎赉诺尔墓群作为汉代的古建筑，被国务院批准列入第六批全国重点文物保护单位名单。