该海域是沪、杭、甬、嵊海上交通要道，地理位置优越。五峙山列岛由大五峙、小五峙、龙洞山、馒头山、鸦鹊山、无毛山、老鼠山七个岛屿和龙礁、北大礁、大鱼暗礁等五暗礁组成。岛屿保护区面积7000余亩，滩涂面积0.01平方公里，海岸线总长5.4公里，最高海拔46.6米。老鼠山和小五峙山在退潮时与大五峙山连成一片，岛屿外貌呈草甸状，地势呈西南一东北走向。

五峙山列岛凭借其得天独厚的环境条件以及有利的地理位置，为各种生物的繁殖发育提供了良好的自然条件。在该地区共观察记录到湿地鸟42种，分属6目9科，其中留鸟6种，夏候鸟19种，冬候鸟17种，夏季的数量优势种为黑尾鸥和中白鹭，冬季的数量优势种为环颈(行鸟)、苍鹭和班嘴鸭。留鸟为麻雀白头鹎、黄郦及白（背鸟）（令鸟）。

自1988年将五峙山列岛为区级自然保护区以来，经过十几年来的有效保护和管理，黑尾鸥数量由88年的450只增加到2001年3200余只，白鹭由88年的十几只到2001年的4200多只，冬候鸟由1988年的300余只到2001年2000多余只，特别是国家2级保护鸟类黄嘴白鹭由88年的几十只到2001年的500余只，角（辟鸟）（虎鸟）150余只。全年在五峙山列岛繁殖、栖息的各种鸟类已达万余只。现在每逢5—8月登岛观察，群鸟翱翔，景-人。